单细胞测序网讯：近日，由“光遗传学之父”、斯坦福大学研究员卡尔-戴瑟罗斯（Karl Deisseroth）教授联合创办的 Stellaromics 表示，该公司已获得 2500 万美元的A轮融资，用于支持其空间组学技术产品的开发和早期项目。Plaisance Capital Management 和一家位于硅谷的私人家族办公室领投了本轮融资。Stellaromics 的联合创始人、Plaisance 的 Ye Fu 将担任首席技术官，而最近担任 Cantata Bio 首席执行官的 Todd Dickinson 将担任首席执行官。该公司表示，他们将利用这笔资金资助其 Plexa 平台的开发，该平台是一种自动化仪器，将运行商业版STARmap（spatially resolved transcript amplification readout mapping）方法。这种三维、高分辨率、空间 omics 工作流程是由 Deisseroth 和 Xiao Wang（现任 Broad 研究所研究员和麻省理工学院教授）共同开发的。公司已获得斯坦福大学和 Broad 研究所对 STARmap 知识产权的独家授权，还获得了相关方法 RiboMap（ribosome-bound mRNA mapping，提供翻译信息）和 STARmap plus（增加样本中蛋白质的数据） 的独家授权。Stellaromics公司还将利用这笔资金在2024年第一季度启动一项仪器早期访问计划和基于服务的技术访问计划。该公司将在波士顿地区招聘员工并建立新的总部。"我们已经大幅提高了信噪比，缩短了成像时间。"Fu 说。"仪器将更加自动化，无需人工操作。一切都将更加精简。"目前，空间组学领域已有先行者进场。NanoString Technologies 公司、10x Genomics 公司和 Vizgen 公司都已推出了可提供 RNA 和蛋白质数据的高分辨率方法。NanoString 率先将 CosMx 推向市场，10x 的 Xenium 平台也开始占据市场，双方竞争颇为激烈。在过去两年里，该领域的几乎所有公司，包括 Rebus Biosystems 和 Resolve Biosciences，都或多或少进行了裁员。Stellaromics 选择在这样的时机进入单细胞空间转录组学市场，却对此并不担心，该公司认为市场还处于起步阶段。Dickinson说："整个行业才刚刚开始。"他估计空间生物学市场的规模可能高达 120 亿美元，而其中只有 5% 的市场已经被渗透。Stellaromics 公司希望 STARmap 在分析较厚组织切片方面能其脱颖而出，尤其是在肿瘤微环境和神经研究等应用领域。毕竟，它起源于 Deisseroth 的大脑实验室。Wang 在 Deisseroth 的实验室做博士后时就和 Deisseroth 一起开发出了STARmap，该成果在2018年7月发表在 Science 杂志上。STARmap 是一种原位技术，它使用挂锁探针和连接测序来揭示特定基因的条形码。在首次发表论文时，该技术已经展示了识别 1000 多种基因的能力，但主要受到光学物理的限制。这种方法的空间分辨率接近光的衍射极限：对于单个转录本而言，空间分辨率可达 100 纳米或更高。随后，Wang 又开发了更多基于 STARmap 的检测方法，包括 RiboMap 和 STARmap plus 等。在今年发表的一篇论文中，Wang 的实验室使用了两倍长（10 bp）的条形码，理论上可用于对多达2万个基因进行条形码检测，足以覆盖整个人类基因转录组。Stellaromics 公司首席技术官 Fu 说，公司希望推出一种覆盖250到500个基因的细胞分型检测方法。该检测将包含一些预选内容，但也允许定制。这将接近于 10x 的 Xenium 的约 300 个基因 panel，少于 CosMx 的 1000 个基因panel。该检测将在一个名为 Plexa 的自动化平台上运行。Plexa 能一次运行12个样本，每个圆孔的直径为15毫米，面积约为175平方毫米。据 Fu 介绍，运行时间 "与其他空间组学平台相似"，根据分析基因的数量，需要两天或更长时间。Stellaromics 强调，STARmap 的三维功能是与众不同之处。Fu说："厚的组织可以看到薄片上缺少的信息。STARmap 分析法可以分析薄至 5 微米的组织，但通常处理的切片范围在 20 微米到 50 微米之间。厚组织分析流程可以处理100微米到200微米的组织。"Dickinson 说："我们的根基在神经领域，因此该产品非常适合神经领域的市场。免疫肿瘤学研究领域也与该平台相契合，因为额外的深度可以提供更多有关肿瘤微环境和细胞相互作用的信息。皮肤和视网膜样本也可以通过这项技术解析。"Wang 表示，根据她收到的寻求故障排除帮助的电子邮件数量，有10到20家实验室正在运行 STARmap，这也是 Stellaromics 的潜在客户群。Dickinson 预测，早期的客户将偏向学术研究，只有约25%的客户来自制药公司；不过，他说："在未来五年左右的时间里，我们将看到转变。"Stellaromics 公司的 Plexa 平台还没有最终定价，不过他们正致力于降低每个样本的成本，目前的成本在2500美元到4000美元之间。Fu 表示，与其他方法相比，STARmap 测定使用的探针更少，这可以降低成本。但是，由于使用共焦显微镜，该仪器的价格 "可能会偏高"。参考资料：
1.https://www.genomeweb.com/business-news/stellaromics-use-25m-series-financing-spatial-omics-product-development-access
2.https://www.prnewswire.com/news-releases/stellaromics-secures-25-million-in-series-a-funding-to-advance-3d-spatial-multi-omic-profiling-301975277.html
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