尝鲜价最后期限| PacBio MAS-Seq 揭秘单细胞全长转录本信息

发表时间:2023-06-16 17:59

















单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)能够表征源自复杂组织的单个细胞之间的基因表达差异,提供比传统 RNA-Seq 更高分辨率的信息。目前,绝大部分的单细胞 RNA 测序都是基于 NGS 测序平台完成的,由于 NGS 测序读长短的原因,转录本均需要片段化后进行测序,只能得到转录本的各端的信息,得到的测序数据只能提供细胞内基因水平的表达信息,缺少可能对疾病或生物功能发挥十分关键作用的重要异构体多样性等信息。


为解决以上问题,PacBio 推出了 MAS-Seq试剂盒,通过将短的 cDNA 进行串联建库的方式连接起来再进行HiFi测序,从而解决了长读长单细胞 RNA 测序的通量瓶颈。


PacBio MAS-Seq的主要特点:



1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA;
2. cDNA 起始量为 15-75 ng;
3. 相较于传统常规单细胞Iso-Seq文库,MAS-Seq将通量扩展了16倍;
4. 突破传统基因水平研究,得到更多全长转录本信息;
5. 在单细胞水平上,实现多样化全长转录本的表征;
6. 研究发现细胞种类特异性的可变剪切群体,及其表达差异;
7. 可以全面解析单细胞的可变剪切、mRNA点突变和融合基因等信息;
8. 一个文库即可以获得 3000-10000 个细胞的转录本水平信息;
9. 当搭配Sequel II/IIe   SMRTcell 8M 测序芯片时,可产生 4000 万条转录本序列;
10. 当搭配Revio SMRTcell 25M 测序芯片时,可产生 8000 万条转录本序列。


MAS-Seq 示例(PBMC 数据集)
Sequel II/IIe 和 Revio 系统上运行的 PBMC MAS-Seq 文库的 read、细胞和转录本统计数据。

SMRT Link v11.1分析后使用CellTypist获得的Revio-PBMC 2的UMAP细胞聚类。

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      产品名称: MAS-Seq for 10X Single Cell 3’  

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关于PacBio

Pacific Biosciences of California, Inc.(纳斯达克股票代码:PACB)是一家领先的生命科学技术公司,致力于设计、开发和制造先进的测序解决方案,以帮助科学家和临床研究人员解决基因复杂的问题。PacBio正在开发的产品和技术源于两项高度差异化的核心技术,专注于准确性、质量和完整性,包括现有的 HiFi 长读长测序和新兴的 SBB 短读长测序技术。PacBio的产品解决了广泛的研究应用,包括人类生殖细胞测序、植物和动物科学、传染病和微生物学、肿瘤学以及其他新兴应用。

*PacBio 产品仅供研究使用。不用于临床诊断。

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